ABC-cassette transporter 1 (ABCA1) expression in epithelial cells in Chlamydia pneumoniae infection

Korhonen, Juha T.; Olkkonen, Vesa M.; Lahesmaa, Riitta; Puolakkainen, Mirja
Microbial pathogenesis, 2013
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Activation of Plasmacytoid Dendritic Cells in Colon-Draining Lymph Nodes during Citrobacter rodentium Infection Involves Pathogen-Sensing and Inflammatory Pathways Distinct from Co...

Toivonen R, Kong LJ, Rasool O, Lund RJ, Lahesmaa R, Hanninen A
journal immunology, 2016
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

An additive Gaussian process regression model for interpretable non-parametric analysis of longitudinal data

Cheng, Lu; Ramchandran, Siddharth; Vatanen, Tommi; Lietzén, Niina; Lahesmaa, Riitta; Vehtari, Aki; Lähdesmäki, Harri
nature communications, 2019
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

AMIGO2 modulates T cell functions and its deficiency in mice ameliorates experimental autoimmune encephalomyelitis

Li, Zhilin; Khan, Mohd Moin; Kuja-Panula, Juha; Wang, Hongyun; Chen, Yu; Guo, Deyin; Chen, Zhi Jane; Lahesmaa, Riitta; Rauvala, Heikki; Tian, Li
brain behavior immunity, 2017
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Analysis of the plasma proteome using iTRAQ and TMT-based Isobaric labeling

Robert Moulder, Santosh D. Bhosale, David R. Goodlett, Riitta Lahesmaa
mass spectrometry reviews, 2018
A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Analyzing Th17 cell differentiation dynamics using a novel integrative modeling framework for time-course RNA sequencing data

Intosalmi, Jukka; Ahlfors, Helena; Rautio, Sini; Mannerstöm, Henrik; Chen, Zhi, Jane; Lahesmaa, Riitta; Stockinger, Birgitta; Lähdesmäki, Harri
bmc systems biology, 2015
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Atopic asthma after rhinovirus-induced wheezing is associated with DNA methylation change in the SMAD3 gene promoter.

Lund, R. J.; Osmala, M.; Malonzo, M.; Lukkarinen, M.; Leino, Annamari; Salmi, Jussi; Vuorikoski, S.; Turunen, R.; Vuorinen, T.; Akdis, C.; Lähdesmäki, H.; Lahesmaa, Riitta; Jartti, T.
allergy european journal allergy clinical immunology supplement, 2018
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Characterization and non-parametric modeling of the developing serum proteome during infancy and early childhood

Lietzen, Niina; Cheng, Lu; Moulder, Robert; Siljander, Heli; Laajala, Essi; Härkönen, Taina; Peet, Aleksandr; Vehtari, Aki; Tillmann, Vallo; Knip, Mikael; Lahdesmaki, Harri; Lahesmaa, Riitta
scientific reports, 2018
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Chlamydia pneumoniae entry into epithelial cells by clathrin-independent endocytosis

Korhonen, Juha T.; Puolakkainen, Mirja; Haveri, Anu; Tammiruusu, Anne; Sarvas, Matti; Lahesmaa, Riitta
Microbial pathogenesis, 2012
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

CIP2A Constrains Th17 Differentiation by Modulating STAT3 Signaling

Khan, Mohd Moin; Ullah, Ubaid; Khan, Meraj H.; Kong, Lingjia; Moulder, Robert; Välikangas, Tommi; Bhosale, Santosh Dilip; Komsi, Elina; Rasool, Omid; Chen, Zhi; Elo, Laura L.; Westermarck, Jukka; Lahesmaa, Riitta
iscience, 2020
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

CIP2A Promotes T-Cell Activation and Immune Response to Listeria monocytogenes Infection

Christophe Côme, Anna Cvrljevic, Mohd Moin Khan, Irina Treise, Thure Adler, Juan Antonio Aguilar-Pimentel, Byron Au-Yeung, Eleonora Sittig, Teemu Daniel Laajala, Yiling Chen, Sebastian Oeder, Julia Calzada-Wack, Marion Horsch, Tero Aittokallio, Dirk H. Busch, Markus W. Ollert, Frauke Neff, Johannes Beckers, Valerie Gailus-Durner, Helmut Fuchs, Martin Hrabe de Angelis, Zhi Chen, Riitta Lahesmaa, Jukka Westermarck
plos one, 2016
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Comparative analysis of human and mouse transcriptomes of Th17 cell priming

Tuomela, Soile; Rautio, Sini; Ahlfors, Helena; Öling, Viveka; Salo, Verna; Ullah, Ubaid; Chen, Zhi; Hämälistö, Saara; Tripathi, Subhash K.; Äijö, Tarmo; Rasool, Omid; Soueidan, Hayssam; Wessels, Lodewyk; Stockinger, Brigitta; Lähdesmäki, Harri; Lahesmaa, Riitta
oncotarget, 2016
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Continuous hypoxic culturing of human embryonic stem cells enhances SSEA-3 and MYC levels

Närvä E; Pursiheimo J-P; Laiho A; Rahkonen N; Emani M R; Viitala M; Laurila K; Sahla R; Lund R; Lähdesmäki H; Jaakkola P; Lahesmaa R
PLoS ONE, 2013
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Copy number variation and selection during reprogramming to pluripotency

Hussein, Samer M.; Batada, Nizar N.; Vuoristo, Sanna; Ching, Reagan W.; Autio, Reija; Narva, Elisa; Ng, Siemon; Sourour, Michel; Hämäläinen, Riikka; Olsson, Cia; Lundin, Karolina; Mikkola, Milla; Trokovic, Ras; Peitz, Michael; Bruestle, Oliver; Bazett-Jones, David P.; Alitalo, Kari; Lahesmaa, Riitta; Nagy, Andras; Otonkoski, Timo
Nature, 2011
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Coxsackievirus B Persistence Modifies the Proteome and the Secretome of Pancreatic Ductal Cells

Lietzén, N.;Hirvonen, K.;Honkimaa, A.;Buchacher, T.;Laiho, J.E.;Oikarinen, S.;Mazur, M.A.;Flodström-Tullberg, M.;Dufour, E.;Dufour, E.;Sioofy-Khojine, A.-B.;Hyöty, H.;Hyöty, H.;Lahesmaa, R.;Sioofy Khojine, Amirbabak
iscience, 2019
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Coxsackievirus B1 reveals strain specific differences in plasmacytoid dendritic cell mediated immunogenicity

H\303\244m\303\244l\303\244inen Sanna, Ahlfors Helena, Oikarinen Sami, Sioofy-Khojine Amir-Babak, Frisk Gun, Oberste M. Steven, Lahesmaa Riitta, Pesu Marko, Hy\303\266ty Heikki
Journal of medical virology, 2014
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

CRISPR/Cas9 guided genome and epigenome engineering and its therapeutic applications in immune mediated diseases

Singh D., Hawkins R., Lahesmaa R., Tripathi S.
Seminars in Cell and Developmental Biology, 2019
A2 Katsausartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

DNA methylation and Transcriptome Changes Associated with Cisplatin Resistance in Ovarian Cancer

Riikka J. Lund, Kaisa Huhtinen, Jussi Salmi, Juha Rantala, Elizabeth V. Nguyen, Robert Moulder, David R. Goodlett, Riitta Lahesmaa, Olli Carpén
Scientific Reports, 2017
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Early childhood infections and the use of antibiotics and antipyretic-analgesics in Finland, Estonia and Russian Karelia.

Mustonen, Neea;Siljander, Heli;Peet, Aleksandr;Tillmann, Vallo;Harkonen, Taina;Ilonen, Jorma;Hyoty, Heikki;Knip, Mikael;Koski, Katriina;Koski, Matti;Ryhanen, Samppa;Hamalainen, Anu-Maaria;Ormisson, Anne;Ulich, Valentina;Kuzmicheva, Elena;Mokurov, Sergei;Markova, Svetlana;Pylova, Svetlana;Isakova, Marina;Shakurova, Elena;Petrov, Vladimir;Dorshakova, Natalya, V;Karapetyan, Tatyana;Varlamova, Tatyana;Kiviniemi, Minna;Alnek, Kristi;Janson, Helis;Uibo, Raivo;von Mutius, Erika;Weber, Juliano;Ahlfors, Helena;Kallionpaa, Henna;Laajala, Essi;Landesmaki, Harri;Lahesmaa, Riitta;Moulder, Robert;Nieminen, Janne;Ruohtula, Terhi;Vaarala, Outi;Honkanen, Hanna;Kondrashova, Anita;Oikarinen, Sami;Harmsen, Hermie J. M.;De Goffau, Marcus C.;Welling, Gjalt;Alahuhta, Kirsi;Virtanen, Suvi M.
acta paediatrica, 2019
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Early Detection of Peripheral Blood Cell Signature in Children Developing Beta-Cell Autoimmunity at a Young Age

Kallionpää, Henna; Somani, Juhi; Tuomela, Soile; Ullah, Ubaid; de Albuquerque, Rafael; Lönnberg, Tapio; Komsi, Elina; Siljander, Heli; Honkanen, Jarno; Härkönen, Taina; Peet, Aleksandr; Tillmann, Vallo; Chandra, Vikash; Anagandula, Mahesh Kumar; Frisk, Gun; Otonkoski, Timo; Rasool, Omid; Lund, Riikka; Lähdesmäki, Harri; Knip, Mikael
diabetes, 2019
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä